A história de Blue Exorcist gira em torno de Rin Okumura, um adolescente que, junto de seu irmão gêmeo, Yukio, foi criado por um famoso exorcista. Certo dia, Rin descobre que é, na verdade, o filho de Satanás, o deus dos demônios. Após uma tragédia que o faz perder seu mentor, Rin decide não sucumbir ao seu destino e, para vingá-lo, ingressa na Academia Vera Cruz, uma escola para exorcistas, com o objetivo de se tornar um.
O enredo acompanha Rin enquanto ele tenta controlar seus poderes demoníacos, se adaptar à vida na escola, e treinar para se tornar um exorcista. Ele faz amizade com outros alunos e precisa esconder sua identidade para não ser morto, enfrentando diversos demônios e desafios ao longo do caminho.
